Nagasaki ocupa as encostas em volta de uma baía profunda no oeste de Kyushu. Fundada como porto por comerciantes portugueses no século 16, recebeu missionários jesuítas e virou o centro do cristianismo no Japão, até a proibição da religião no começo do século 17. Durante mais de dois séculos de isolamento do país, foi o único porto aberto ao comércio com os holandeses, na ilha artificial de Dejima, e com os chineses, num bairro próprio. Essa história deixou na cidade templos chineses, igrejas, doces de origem portuguesa, como o castella, e uma cozinha mista.
No fim do século 19, comerciantes britânicos e de outros países se instalaram na encosta de Minamiyamate, hoje o Jardim Glover, e a cidade se tornou um centro da industrialização do Japão, com estaleiros e minas de carvão como a da ilha de Hashima, a Gunkanjima. Esses lugares fazem parte dos Sítios da Revolução Industrial Meiji, e a Catedral de Oura, dos Sítios dos Cristãos Ocultos, ambos Patrimônio Mundial da UNESCO.
Em 9 de agosto de 1945, a segunda bomba atômica usada numa guerra explodiu sobre o bairro de Urakami, no norte da cidade. O Parque da Paz, o parque do Hipocentro e o Museu da Bomba Atômica guardam essa memória e recebem a cerimônia anual pela paz.
A cidade se percorre de bonde, com ladeiras e escadarias entre os bairros. O monte Inasa, do outro lado da baía, mostra a cidade iluminada à noite. A comida inclui o champon, macarrão com frutos do mar e legumes, e o sara-udon, de macarrão crocante.
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